识别冷acclimation-responsive杜鹃基因对脂质代谢,膜运输和木质素生物合成:适度丰富的est序列在基因组研究的重要性。

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魏H, Dhanaraj AL, Arora R,罗兰LJ,傅Y,太阳L

识别冷acclimation-responsive杜鹃基因对脂质代谢,膜运输和木质素生物合成:适度丰富的est序列在基因组研究的重要性。

植物细胞包围。2006年4月,29 (4):558 - 70。

PubMed ID

17080607 (在PubMed

]

文摘

我们以前分析表达序列标签(est) non-acclimated (NA)和cold-acclimated (CA)杜鹃叶,和确定高度丰富的互补dna(互补)可能涉及在寒冷的适应环境。潜在意义重大,但相对未开发,应用这些EST数据集的研究是比较丰富的互补,比如只选1 - 3次从每个杜鹃EST库包含大约430个EST序列。使用统计检验和北部的印迹,我们确定的概率微分表达式适度丰富基于EST数据的互补,事实上,相当准确地预测他们的“真实”upregulation 11 13的差别或对这些互补(85%)研究符合这一标准。分析还显示四个方面山白冷适应的组织。首先,伴随upregulation长链acyl-coenzyme(酰coa)合成酶,CTP: cholinephosphate cytidylyltransferase和δ12脂肪酸desaturase CA叶组织表明,磷脂生物合成和稀释在杜鹃冷硬化的重要组成部分。其次,upregulation plastidic烟酰胺腺嘌呤二核苷酸phosphatemalic酶(NADP-ME) CA组织表明,苹果酸乙酰辅酶a的一个重要来源用于脂肪酸生物合成在寒冷的适应环境。第三,下调的质膜内在蛋白(PIP) 2 - 1水通道蛋白和upregulation大门向外整流K +通道(植物人)CA组织可能与保护过冬离开freeze-induced细胞脱水。第四,upregulation coumarate 3-hydroxylase在CA可能与细胞壁增厚有关组织。生理的影响这些结果,揭示潜在的小说在过冬规定低温驯化伍迪常青树,进行了讨论。这项工作突出的重要性也调查低/适度丰富的est序列(除了高度丰富的)在基因组研究中,它提供了一个有效的策略识别与压力相关的基因,特别是大规模cDNA序列/微阵列研究是不可能的。

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
NADH	NADP-dependent苹果酸脱氢酶、线粒体	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节