动力学原理对N - c端氧依赖性的选择性降解域基板由一个循环的低氧诱导因子prolyl羟化酶。
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Chowdhury劣绅E, Bagg EA, R, Mecinovic J, Loenarz C,麦克多诺妈,款KS,斯科菲尔德CJ
动力学原理对N - c端氧依赖性的选择性降解域基板由一个循环的低氧诱导因子prolyl羟化酶。
J生物化学杂志。2008年2月15日,283(7):3808 - 15所示。Epub 2007 12月5。
- PubMed ID
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18063574 (在PubMed]
- 文摘
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羟基化的两个守恒prolyl残留在N - c端氧依赖性退化域(诺德和科德)alpha-subunit的低氧诱导因子(HIF)信号通过ubiquitin-proteasome降解途径。在人类细胞中,三个prolyl羟化酶(博士1 - 3)属于铁(II)和2-oxoglutarate (2 og)端依赖家庭加氧酶催化prolyl羟基化不同选择性科德和诺德。序列分析的催化域PHD2博士的晶体结构,和其他2 og加氧酶,结果表明,c端地区或循环连接两个beta-strands (beta2和人类PHD2 beta3)是重要的在确定底物选择性。突变分析PHD2透露,beta2beta3循环是一个主要的决定因素在赋予选择性科德诺德肽。的嵌合博士beta2beta3 PHD2循环与PHD3显示一个几乎完全取代了选择性的科德(在竞争实验),作为野生型PHD3观察。科德观察结合更紧密嵌合蛋白质比野生型PHD2催化领域。