提出了质子航天飞机从酿酒酵母saccharopine脱氢酶的机制。

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徐H, Alguindigue SS、西啊,库克PF

提出了质子航天飞机从酿酒酵母saccharopine脱氢酶的机制。

生物化学。2007年1月23日,46 (3):871 - 82。

PubMed ID

17223709 (在PubMed

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(Saccharopine脱氢酶(N6) - glutaryl-2 -L-lysine: NAD氧化还原酶(赖氨酸形成)]催化中的最后一步alpha-aminoadipate赖氨酸生物合成途径。它催化可逆吡啶nucleotide-dependent saccharopine生成的氧化脱氨基作用alpha-Kg和赖氨酸使用NAD +作为氧化剂。质子航天飞机化学机理的基础上,提出了动力学参数对pH值的依赖关系,为竞争性抑制剂离解常数,同位素效应。赖氨酸的方向形成,一旦NAD +和saccharopine绑定,一群pKa 6.2接受质子saccharopine仲胺的氧化。质子化了的一般基础又不参与反应,直到赖氨酸形成完成的反应。一般基础的pKa 7.2接受质子的席夫碱碳水,因为它袭击saccharopine carbinolamine中间。相同的残渣则作为一般酸和捐赠一个质子carbinolamine氮给质子化了的carbinolamine。carbinolamine崩溃然后通过同一组接受质子的carbinolamine羟基生成alpha-Kg和赖氨酸。胺氮然后使质子化的组织,最初接受质子的仲胺saccharopine,和产品的发行。逆反应方向,有限主要氘动力学同位素效应观察所有参数除了V2 / K (NADH),符合一个稳态随机机制和指示性的贡献从氢化物转移率限制。 The pH dependence, as determined from the primary isotope effect on DV2 and D(V2/K(Lys)), suggests that a step other than hydride transfer becomes rate-limiting as the pH is increased. This step is likely protonation/deprotonation of the carbinolamine nitrogen formed as an intermediate in imine hydrolysis. The observed solvent isotope effect indicates that proton transfer also contributes to rate limitation. A concerted proton and hydride transfer is suggested by multiple substrate/solvent isotope effects, as well as a proton transfer in another step, likely hydrolysis of the carbinolamine. In agreement, dome-shaped proton inventories are observed for V2 and V2/K(Lys), suggesting that proton transfer exists in at least two sequential transition states.

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
NADH	Alpha-aminoadipic semialdehyde合酶、线粒体	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节