内切核糖核酸酶的描述人类apurinic / apyrimidinic酶1的活性部位。
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Kim WC Berquist BR, Chohan M, Uy C,威尔逊DM 3日,李CH
内切核糖核酸酶的描述人类apurinic / apyrimidinic酶1的活性部位。
J杂志。2011年9月2,411 (5):960 - 71。doi: 10.1016 / j.jmb.2011.06.050。Epub 2011年7月6日。
- PubMed ID
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21762700 (在PubMed]
- 文摘
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1 Apurinic / apyrimidinic核酸内切酶(APE1)是主要的哺乳动物的DNA碱基切除修复酶的劈开了DNA的磷酸二酯骨干立即5 '步行不能的网站。最近,我们发现劈开APE1作为内切核糖核酸酶原癌基因mRNA在体外特定的编码区,调节细胞的原癌基因mRNA水平和半衰期。这里,我们进一步APE1的内切核糖核酸酶活动特征,重点对酶的活性部位中心之前定义的DNA核酸酶的活动。我们发现大多数定点APE1突变蛋白(N68A、D70A Y171F, D210N, F266A, D308A,和H309S),哪个目标氨基酸残基构成的步行不能的DNA酶活性部位的口袋里,显示内切核糖核酸酶活性显著降低。有趣的是,D283N APE1突变蛋白保留内切核糖核酸酶和步行不能的单链RNA劈理活动,与并发apurinic损失/ apyrimidinic(美联社)网站单链DNA双链DNA和分裂活动(ssDNA)。绑定原癌基因突变蛋白同样RNA作为野生型(WT) APE1 H309N除外,这表明这些残留物主要贡献RNA催化RNA绑定。有趣的是,内切核糖核酸酶和ssRNA美联社网站乳沟WT APE1出席的活动缺乏镁(2 +)的情况下,虽然ssDNA美联社站点乳沟需要镁(2 +)(最理想的是在0.5 - -2.0毫米)。我们还发现,2 -哦糖一半是绝对必需的RNA WT APE1乳沟,符合APE1留下3 ' po(4)(2)组解理的RNA。总之,我们的数据支持这一概念,一个常见的活性部位是共享APE1内切核糖核酸酶和其他核酸酶活动的;然而,我们提供的证据表明,机制裂开RNA,步行不能的单链RNA, APE1不相同和步行不能的DNA的观察,对解开APE1体内的内切核糖核酸酶功能的影响。