晶体复合物的预测S-adenosylmethionine-dependent甲基转移酶显示一个典型的AdoMet绑定域和底物识别领域。
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米勒DJ, Ouellette) N, Evdokimova E, sachenko,爱德华兹,安德森WF
晶体复合物的预测S-adenosylmethionine-dependent甲基转移酶显示一个典型的AdoMet绑定域和底物识别领域。
蛋白质科学。2003年7月,12 (7):1432 - 42。
- PubMed ID
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12824489 (在PubMed]
- 文摘
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S-adenosyl-L-methionine-dependent甲基转移酶(MTs)丰富,和高度保守的发展史。这些酶甲醇使用代数余子式AdoMet各种各样的分子靶点,从而调节细胞和代谢的重要活动。Thermotoga maritima蛋白0872 (TM0872)属于一个大序列预测MTs的家庭,包括过去的人类从相对简单的细菌。许多细菌同源染色体的基因是位于操纵子参与细胞壁合成和细胞分裂。尽管初步的生化研究在大肠杆菌和枯草芽孢杆菌,这群超过150的底物特异性蛋白质是未知的。作为中西部地区的一部分,结构基因组学中心倡议(www.mcsg.anl.gov),我们已经确定TM0872在复合物的结构与AdoMet和S-adenosyl-L-homocysteine (AdoHcy)。正如预测的那样,TM0872典型MT域,并将内生AdoMet绑定,或者co-crystallized AdoHcy,的方式与其他已知的MT结构一致。此外,TM0872第二个域是小说在MTs在序列中的位置和它的结构。第二个域可能在底物识别和行为约束力,还有一个潜在的substrate-binding裂跨越两个领域。这个狭长的裂两旁带正电的残留物,位于对面S (+) ch(3)债券,这表明一个带负电荷的分子可能针对催化。 However, AdoMet and AdoHcy are both buried, and access to the methyl group would presumably require structural rearrangement. These TM0872 crystal structures offer the first structural glimpses at this phylogenetically conserved sequence family.