从流感嗜血杆菌结构YibK甲基转移酶(HI0766):代数余子式绑定网站由一个结。
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Lim K,张H, Tempczyk Krajewski W,伯纳德N, Toedt J,霍华德,艾森斯坦E,赫兹伯格O
从流感嗜血杆菌结构YibK甲基转移酶(HI0766):代数余子式绑定网站由一个结。
蛋白质。2003年4月1日,51 (1):56 - 67。
- PubMed ID
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12596263 (在PubMed]
- 文摘
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YibK的晶体结构从流感嗜血杆菌(HI0766)已经确定有或没有绑定代数余子式产品S-adenosylhomocysteine (AdoHcy)分辨率1.7和2.0,分别。分子采用一个α/β折叠,拓扑结构,不同于经典的甲基转移酶。最值得注意的是,HI0766包含一个引人注目的结,形成了绑定代数余子式的缝隙。结的形成与二级结构单元的交错布置与古典甲基转移酶。两个循环区域发生构象变化在AdoHcy绑定。与扩展的代数余子式的古典甲基转移酶的构象结构,AdoHcy HI0766结合在一个弯曲的构象。HI0766和它相近的序列都是短的版本更远程相关rRNA / tRNA spoU序列的甲基转移酶家族。我们建议spoU序列家族包含相同的核心域代数余子式绑定作为衬底HI0766但额外域绑定。substrate-binding域HI0766序列中缺席家庭和可能提供的另一种流感嗜血杆菌伴侣蛋白,还未被识别。