晶体结构的蛋白质isoaspartyl甲基转移酶:蛋白质修复的催化剂。
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斯金纳MM, Puvathingal JM,沃尔特RL,弗里德曼
晶体结构的蛋白质isoaspartyl甲基转移酶:蛋白质修复的催化剂。
结构。2000年11月15日,8 (11):1189 - 201。
- PubMed ID
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11080641 (在PubMed]
- 文摘
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背景:isoaspartyl残留的形成是为数不多的几个过程,破坏蛋白质随着年龄的。蛋白质L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase (PIMT)是守恒的,几乎无处不在的酶,这种酶催化蛋白质的修复受损isoaspartyl形成。结果:我们已经确定的第一PIMT从晶体结构t maritima酶复合体S-adenosyl-L-homocysteine (AdoHcy)和精制1.8一项决议。虽然PIMT形成一个结构单元,蛋白质的功能可以分为三个子域。中央子域名相似其他S-adenosyl-L-methionine-dependent甲基转移酶,但熊的一个显著改变拓扑连接,这不是由这个家庭的其他成员共享。而不是安排与拓扑混合测试表6向上arrow7向下向上arrow5 arrow4向上向上arrow1 arrow2向上arrow3向上箭头,中央一张PIMT重组7向上arrow6向下向上arrow5 arrow4向上向上arrow1 arrow2向上arrow3向上箭头。AdoHcy主要是氨基和中央子域之间埋守恒和很大程度上疏水环绑定的一个边缘崩裂,和守恒的Ser / Thr-richβ链。Ser / Thr-rich链可能提供特定的相互作用与氢键isoaspartyl基质。ile - 206的侧链,守恒的残渣,穿过崩裂,限制访问捐赠者甲基深井,假定的isoaspartyl甲基受体站点。结论:PIMT揭示了一个独特的结构改性甲基转移酶的折叠为一个网站的特定识别isoaspartyl基质。 The sequence conservation among PIMTs suggests that the current structure should prove a reliable model for understanding the repair of isoaspartyl damage in all organisms.