的氨基酸序列比较transacylase组件的支链oxoacid脱氢酶的假单胞菌putida,丙酮酸和2-oxoglutarate脱氢酶的大肠杆菌。
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布朗烧伤G, T,帽匠K, Sokatch JR .
的氨基酸序列比较transacylase组件的支链oxoacid脱氢酶的假单胞菌putida,丙酮酸和2-oxoglutarate脱氢酶的大肠杆菌。
欧元。1988年9月1日,176 (1):165 - 9。
- PubMed ID
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3046941 (在PubMed]
- 文摘
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bkdB的核苷酸序列,E2b的结构基因,transacylase组件branched-chain-oxoacid脱氢酶的假单胞菌putida已经确定,翻译成氨基酸序列。开始bkdB被确认的n端序列E2b隔绝branched-chain-oxoacid脱氢酶密切相关的物种,铜绿假单胞菌。65.5%的阅读框由G + C以82.3%的基码以G或C没有基因间bkdA2和bkdB之间的空间。没有利用密码子要求小图示和密码子偏好指数表明优惠密码子使用。bkdB基因编码423个氨基酸虽然氨基蛋氨酸是缺席E2b准备从铜绿假单胞菌。编码蛋白质的相对分子质量为45134(45003 -蛋氨酸)vs 47000通过SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。有一个lipoyl域E2b E2p三lipoyl域相比,和一个域E2o, transacylases丙酮酸和2-oxoglutarate脱氢酶分别为大肠杆菌。有显著的相似性E2b lipoyl域和E2p E2o以及E2b E1-E2绑定域之间,E2p E2o。之间没有相似的E3绑定域E2b E2p和E2o这可能反映的独特性的E3分量p . putida branched-chain-oxoacid脱氢酶。这些比较得出的结论是,原核的transacylases丙酮酸,2-oxoglutarate和branched-chain-oxoacid脱氢酶是从一个共同祖先的蛋白质可能大约在同一时间。