宪法和溶液构象的抗生素mersacidin由NMR和分子动力学。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
瑙曼Prasch T, T, Markert RL,解决M,舒伯特W, Schaal年代,胃痛,Kogler H, Griesinger C
宪法和溶液构象的抗生素mersacidin由NMR和分子动力学。
3月1。1997欧元;244(2):501 - 12所示。
- PubMed ID
-
9119018 (在PubMed]
- 文摘
-
的解决方案结构四环的lantibiotic mersacidin在甲醇(CD3OH)由NMR紧随其后的是距离约束驱动的动力学和随后的抑制分子动力学模拟结合迭代松弛矩阵由模拟退火方法,或者协议。琥珀色的分子动力学模拟进行程序系统和洞察力的程序包。绑定驱动进行了动力学计算的距离使用修改后的版本的DISGEO II项目。interproton距离限制来自跳使对称旋转系统奥佛好塞增强交易(JS-ROESY)光谱,为中型分子mersacidin产量最佳灵敏度。通过硫化连接性桥梁被明确地证实了异核核磁共振技术(异核单量子相干和杂环的多重键相关方法)。由于四环的结构,mersacidin展品,而刚性球形,它既不属于duramycin也lantibiotics乳酸链球菌肽结构类型。由此产生的结构模拟退火协议的约束和随后的自由分子动力学比较,发现非常相似。