三维结构的adenosylcobinamide磷酸激酶/ adenosylcobinamide guanylyltransferase从鼠伤寒沙门氏菌决心2.3决议,。
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汤普森结核病,托马斯毫克,Escalante-Semerena JC, Rayment我
三维结构的adenosylcobinamide磷酸激酶/ adenosylcobinamide guanylyltransferase从鼠伤寒沙门氏菌决心2.3决议,。
生物化学。1998年5月26日,37 (21):7686 - 95。
- PubMed ID
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9601028 (在PubMed]
- 文摘
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的x射线结构adenosylcobinamide磷酸激酶/ adenosylcobinamide guanylyltransferase (CobU)鼠伤寒沙门氏菌已经决心2.3一项决议。这种酶的亚基分子量19 770过程中扮演着重要的角色在组装adenosylcobalamin核苷酸循环的,它催化的磷酸化1-amino-2-propanol科林环侧链和随后的附件产品adenosylcobinamide-GDP GMP的形式。相关的激酶活性被认为是P-loop图案,而转移酶活动收益在不同的网站上通过guanylyl中间酶。酶固定在空间群C2221的单胞尺寸= 96.4,b = 114.4 a, c = 106.7,三个子单元每个不对称单元。酶分子的结构揭示了三聚物和看起来有点像螺旋桨整体分子的尺寸大约64 x 77 x 131。每个单元由一个域是由seven-stranded混合β褶板侧面两边总共五个阿尔法螺旋和一个螺旋。六的七beta-strands并行运行。c端链位于边缘的负债表和反平行的运行。有趣的是,CobU显示显著的结构和拓扑相似的核心领域RecA蛋白质,虽然这一观点的原因还不清楚。结构包含一个P-loop主题位于著名的基础裂缝形成的两个子单元和最有可能的关联激酶活性部位。 Each subunit of CobU contains a cis peptide bond between Glu80 and Cys81 where Glu80 faces the P-loop and might serve to coordinate the magnesium ion of the triphosphate substrate. Interestingly, His46, which is the putative site for guanylylation, lies approximately 21 A from the P-loop and is solvent-exposed. This suggests that the enzyme undergoes a conformational change when the substrates bind to bring these two active sites into closer proximity.