人U1A蛋白n端RNP结构域识别U1 snRNA的核磁共振研究。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
何伟，李志刚，李志刚，李志刚
人U1A蛋白n端RNP结构域识别U1 snRNA的核磁共振研究。
EMBO J. 1994 8月15日;13(16):3873-81。
- PubMed ID
-
8070414 (PubMed视图］
- 摘要
-
RNP结构域是在数百种蛋白质中发现的一个非常常见的基序，包括RNA加工机制的许多蛋白质成分。70-90个氨基酸结构域包含两个高度保守的6-8个氨基酸的延伸(RNP-1和RNP-2)，位于四链反平行β -片的中心链上，由一个保守的疏水核心包裹在两个α -螺旋上。利用多维异核磁共振，我们绘制了人U1A蛋白102个氨基酸n端RNP结构域与U1 snRNA茎环II衍生的31位寡核苷酸之间的分子间接触。RNA在蛋白质上诱导的化学位移变化将β -薄片的表面定义为识别界面。蛋白质的反面，有两个α -螺旋，在RNA存在的情况下，仍然暴露在溶剂中，并可能用于剪接体组装或剪接位点选择中的蛋白质-蛋白质接触。蛋白质- rna接触发生在发夹的单链顶端环上，但也发生在相邻的U.G和U.U non-Watson-Crick碱基对的螺旋茎的主要沟槽中。根据目前的结果对所提出的复合物模型进行检查，揭示了RNP蛋白识别RNA的几个特征。这种22 kDa的配合物的光谱质量证明了NMR研究rna -蛋白质配合物的可行性。