丝状的完整基因组序列固氮藻青菌项圈藻sp.应变PCC 7120。

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中村Kaneko T, Y, Wolk CP, Kuritz T, Sasamoto年代,渡边,Iriguchi M,石川,川岛K,木村T, Kishida Y, Kohara M,松本M, Matsuno, Muraki, Nakazaki N, Shimpo S, M,杉本Takazawa M,山田M, Yasuda M, Tabata年代

丝状的完整基因组序列固氮藻青菌项圈藻sp.应变PCC 7120。

DNA研究》2001年10月31日,8 (5):205 - 13;227 - 53。

PubMed ID
11759840 (在PubMed
]
文摘

整个基因组核苷酸序列的丝状藻青菌,项圈藻sp.应变PCC 7120年,决心。淡水藻类的一种的基因组由单个染色体(6413771个基点)和六个质粒,指定pCC7120alpha(408101个基点),pCC7120beta(186614个基点),pCC7120gamma(101965个基点),pCC7120delta(55414个基点),pCC7120epsilon(40340个基点),和pCC7120zeta(5584个基点)。熊5368潜在染色体的编码蛋白的基因,核糖体rna基因的四组,48 tRNA基因代表42 tRNA物种,和4结构的小分子rna基因。预测产品45%的潜在的编码蛋白的基因序列的相似性和预测蛋白质的功能,翻译产品和27%的假设的基因。剩下的28%缺乏显著的相似基因已知和预测蛋白质在公共DNA数据库。60多个基因参与各种异形胞的形成过程和固氮作用是分配给染色体基于报告基因的相似性。一百九十五个基因编码双组分信号转导系统的组件,近2.5倍集胞藻属sp。6803年PCC,被确定的染色体。只有37%的淡水藻类的一种基因显示显著的序列相似性的集胞藻属,表明高度分歧蓝藻两菌株的基因信息。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽
的名字 UniProt ID
Alr1529蛋白质 Q8YWS4 细节
铁氧还蛋白——辅酶ii还原酶 P58558 细节
Flavodoxin P0A3D9 细节
细菌视紫红质 Q8YSC4 细节