一系列meta-cleavage产品水解酶的晶体结构的荧光假单胞菌IP01 (CumD)包裹着各种乳沟产品。
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小君SY Fushinobu年代,Hidaka M, Nojiri H, Yamane H,沾荤腥H, Omori T, Wakagi T
一系列meta-cleavage产品水解酶的晶体结构的荧光假单胞菌IP01 (CumD)包裹着各种乳沟产品。
学生物化学生物科技Biosci》。2005年3月,69 (3):491 - 8。
- PubMed ID
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15784976 (在PubMed]
- 文摘
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Meta-cleavage产品水解酶(MCP-hydrolase)的一个关键酶的微生物降解芳香族化合物。MCP-hydrolase产生2-hydroxypenta-2 4-dienoate和各种有机酸、根据C6衬底的取代基。综合分析MCP-hydrolase的底物特异性的荧光假IP01 (CumD)是由确定动力学参数九基质与八乳沟产品晶体结构复杂化。CumD首选基质长non-branched C6取代基,但没有有效地水解底物苯组。叠加的复杂的结构表明,苯甲酸注定比其他脂肪族乳沟明显不同方向的产品。绑定有机酸的方向似乎与k (cat)的值对应的基板。Ile139和Trp143残留在螺旋alpha4似乎因为位阻衬底的芳环,妨碍了base-catalyzed攻击的水。