在酶催化和特异性糖苷水解:2、5 b的构象glycosyl-enzyme中间的结构揭示了芽孢杆菌agaradhaerens家庭11木聚糖酶。
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萨比尼E, Sulzenbacher G,爱抚,抚摸Z,约根森PL, Schulein M,杜邦C,戴维斯GJ,威尔逊KS
在酶催化和特异性糖苷水解:2、5 b的构象glycosyl-enzyme中间的结构揭示了芽孢杆菌agaradhaerens家庭11木聚糖酶。
化学杂志。1999;6 (7):483 - 92。
- PubMed ID
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10381409 (在PubMed]
- 文摘
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背景:的酶法水解苷涉及的形成和随后的故障通过oxocarbenium-ion-like共价glycosyl-enzyme中间过渡状态。共价中间可能被困使用2-fluoro-substituted苷酶,提供详细的中间构象和共价酶之间的相互作用和低聚糖。木聚糖酶在工业应用很重要——在纸浆和造纸行业,与木聚糖酶预处理木材减少含氯的化学物质的用量。木聚糖酶是多种纤维素酶在结构上相似但不同xylose-based特异性,与葡萄糖基,等基质。结果:家庭11木聚糖酶的结构,Xyl11,从芽孢杆菌agaradhaerens已经解决了使用x射线晶体学在本机和xylobiosyl-enzyme中间形式分辨率1.78和2.0,分别。共价glycosyl-enzyme中间被困使用2-fluoro-2-deoxy衬底与一个好的离去基团。与共价中间结构糖苷水解酶与其他家庭,家庭11中的共价glycosyl-enzyme中间采用一种不同寻常的2、5 b构象。结论:2、5 b的构象发现alpha-linked xylobiosyl-enzyme Xyl11中间,与4 c1椅式构象观察到其他系统,符合所要求的立体化学约束oxocarbenium-ion-like过渡状态。比较Xyl11共价glycosyl-enzyme中间的等效结构相关的家庭12内切葡聚糖酶,CelB,从链霉菌属lividans揭示了可能的决定因素在这个家族的糖苷水解酶底物特异性。