凝血酶-ecotin的晶体结构揭示了构象变化和扩展的相互作用。
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王世祥，Esmon CT, fletcher RJ
凝血酶-ecotin的晶体结构揭示了构象变化和扩展的相互作用。
生物化学，2001 8月28日;40(34):10038-46。
- PubMed ID
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11513582 (PubMed视图］
- 摘要
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蛋白酶抑制剂ecotin不能抑制凝血酶，尽管它对丝氨酸蛋白酶有广泛的特异性。生态素中的点突变(M84R)对凝血酶具有1.5 nM的亲和力，比野生型生态素强10(4)倍。在2.5 A分辨率下测定了牛凝血酶与ecotin M84R突变体配合物的晶体结构。围绕凝血酶活性位点裂缝的表面环发生了显著的结构变化，以允许抑制剂结合。特别是凝血酶中可能介导与大分子相互作用的60和148残基插入环在复合物形成时发生位移。凝血酶和ecotin M84R在两个不同的表面相互作用。残基99上的环和凝血酶c端通过混合极性和非极性相互作用与生态素接触。凝血酶的活性位点被八个连续的ecotin氨基酸填充，并显示了凝血酶对与凝血酶裂解位点相容的特定特征的偏好:带负电- pro - val - x - pro -Arg-疏水-带正电(P1 Arg用黑体字表示)。对P4处Val的偏好是明确定义的。在残基60处的插入可以通过移动作为底物识别位点一部分的相邻环来进一步影响底物结合。