DNA apophotolyase Anacystis nidulans: 1.8结构,8-HDF调整和减少X-ray-induced时尚。
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Kort R,小森H,足立,杨爱瑾K,艾克
DNA apophotolyase Anacystis nidulans: 1.8结构,8-HDF调整和减少X-ray-induced时尚。
Acta Crystallogr D Crystallogr杂志。2004年7月,60 (Pt 7): 1205 - 13所示。Epub 2004年6月22日。
- PubMed ID
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15213381 (在PubMed]
- 文摘
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DNA光裂合酶是一个独特的黄素酶修复DNA损伤UV-induced使用可见光的能量。Anacystis nidulans光裂合酶包含一个聚光发色团,8-hydroxy-5-deazaflavin (8-HDF)和黄素腺嘌呤二核苷酸(时尚),与8-HDF发色团,催化活性是必不可少的。这项工作报告决议1.8的结晶和结构DNA光裂合酶缺乏8-HDF发色团(apophotolyase)。整体全酶的三维结构相似,表明8-HDF的存在并不重要的正确折叠酶。结构变化包括额外的磷酸基,不同的构象Arg11 Met47轻微的重组,Asp101 Asp382,取代部分chromophore-binding 8-HDF分子的口袋里。与合成8-hydroxy-5-deazariboflavin apophotolyase可以有效地重组,尽管Arg11取向和磷酸基的存在8-HDF口袋里。红灯或x射线减少时尚发色团apophotolyase晶体,观察到单晶分光光度法。时尚的结构性影响减少测定比较先后收集的三个数据集在100 K,而减少的程度由光吸收变化在线监测的晶体。X-ray-induced构象变化仅限于蛋白质的活性部位。它们包括sub-angstrom运动的O(2)和N(5)黄素组的原子以及原子O(δ)周围的氨基酸Asp380 Asn386。