左上角的晶体结构dodecameric FMN-dependent UbiX-like脱羧酶(Pad1)从大肠杆菌O157: H7。
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李Rangarajan周二,Y,努志P, Tocilj,挂LW,哑光,Cygler M
左上角的晶体结构dodecameric FMN-dependent UbiX-like脱羧酶(Pad1)从大肠杆菌O157: H7。
蛋白质科学。2004年11月,13 (11):3006 - 16。Epub 2004年9月30日。
- PubMed ID
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15459342 (在PubMed]
- 文摘
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左上角黄素蛋白的晶体结构Pad1从大肠杆菌O157: H7包裹着的代数余子式单核苷酸FMN已经由多个反常衍射的方法和精制2.0一项决议。这种蛋白质是一个假字UbiX (3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase, 51%序列的身份),催化的第三步泛醌左上角生物合成和酿酒酵母Pad1身份(54%),一种酶,对抗菌化合物产生了耐药性phenylacrylic通过这些化合物脱酸。左上角每个Pad1单体由一个典型的包含分子非共价结合的FMN罗斯曼褶皱。左上角的褶皱Pad1 MrsD类似,与lantibiotic合成相关酶;EpiD, peptidyl-cysteine脱羧酶;AtHAL3a,酶,脱羧基4“-phosphopantothenoylcysteine 4”-phosphopantetheine在生物合成辅酶,所有类似的位置两个单体之间的单核苷酸FMN结合位点在界面的,然而每个有小序列相似性。所有这些蛋白质将成低聚物,与三聚物形成共同的结构单元。在MrsD EpiD,属于homo-dodecameric flavin-containing半胱氨酸脱羧酶(HFCD)家族,这些三深入dodecamers联系起来。Pad1还dodecamers形式,尽管协会三完全不同,导致曝光的三聚物单位溶剂的另一面。这种接触会影响底物结合位点的位置,具体地说,其访问FMN代数余子式。 Therefore, Pad1 forms a separate family, distinguishable from the HFCD family.