DNA测序和分析的low-Ca2 +反应质粒pCD1 KIM5鼠疫。
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合作者SC公司的佩里RD史彻Fetherston JD, DJ,格雷戈尔J,布拉特纳FR
DNA测序和分析的low-Ca2 +反应质粒pCD1 KIM5鼠疫。
感染Immun。1998年10月,66(10):4611 - 23所示。
- PubMed ID
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9746557 (在PubMed]
- 文摘
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low-Ca2 +响应(LCR)质粒pCD1鼠疫的鼠疫杆菌剂KIM5测序和分析的基因结构。pCD1(70509个基点)有一个IncFIIA-like复制子和SopABC-like分区地区。我们已经安排了60显然完整的开放阅读框(orf)不包含在转座的元素。其中47被证明或可能LCR、人类致病的主要毒性财产就要spp,之前已经被确认在一个或多个的鼠疫耶尔森氏菌属或致肠病的yersiniae鼠疫enterocolitica和鼠疫的伪。这些47 LCR-related羊痘疮,35集群构成连续电感电容电阻测量。其他LCR-related orf分布在三个完整的插入序列(是)元素(IS100和两个新元素,IS1616和IS1617)转位因子和许多有缺陷的或部分。地区差异百分比GC含量和LCR orf编码效应蛋白之间的额外的一个复杂的历史证据质粒。我们的分析表明,可能增加新的Syc——Yop-encoding操纵子的LCR-related pCD1基因和没有支持YopL的存在。YadA可能并不表示,为鼠疫耶尔森氏菌属EV76一样,脂蛋白YlpA发现的基因y enterocolitica可能是鼠疫杆菌的假基因。yopM基因比此前认为的长(通过两个富亮氨酸重复序列编码),ypkA-yopJ ORF上游的讨论作为一个潜在的Syc基因,和一个之前从未描述子的下游yopE被确定为潜在的重大影响。 Eight other ORFs not associated with IS elements were identified and deserve future investigation into their functions.