嘧啶核苷磷酸化酶的晶体结构在一个封闭的构象。
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Pugmire MJ, Ealick SE
嘧啶核苷磷酸化酶的晶体结构在一个封闭的构象。
结构。1998年11月15日,6 (11):1467 - 79。
- PubMed ID
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9817849 (在PubMed]
- 文摘
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背景:嘧啶核苷磷酸化酶(PYNP)催化的可逆磷酸解嘧啶核苷酸的合成救助途径。在低等生物(例如杆菌stearothermophilus) PYNP接受胸苷和尿苷,而在哺乳动物和其他高等生物是特定的胸苷(指定的胸苷磷酸化酶(TP)。PYNP股票40%的序列相似性(大概重要结构相似)与人类TP,在内作为生长因子在肿瘤血管生成。人们认为TP经历主要构象变化在衬底绑定,因此产生一个活跃的构象。结果:PYNP的晶体结构与底物模拟假尿苷b . stearothermophilus其活跃的站点已经解决了2.1一项决议。这个结构确认的相似性PYNP TP和支持一个封闭的活性构象,这是刚体运动的结果α,α/β域。活性部位间隙,嘧啶和磷酸盐基质结合,在两个域之间。一个亚基的结构揭示了非对称二聚体是完全封闭的,另一个是只有部分关闭。结论:封闭的构象PYNP作为一个好的模型来更好地理解域运动和TP的整体功能。活性位点残基是确认和底物结合的可能机制和后续域运动建议。 Potent inhibitors of TP might have significant therapeutic value in various chemotherapeutic strategies, and the structure of PYNP should provide valuable insight into the rational design of such inhibitors.