延长核糖体蛋白质识别unsequenced菌株使用matrix-assisted激光解吸/电离质谱分析。

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Suh MJ,汉堡DM,格雷戈里·圣Dahlberg AE, Limbach PA

延长核糖体蛋白质识别unsequenced菌株使用matrix-assisted激光解吸/电离质谱分析。

蛋白质组学。2005;12月5(18):4818 - 31所示。

PubMed ID

16287167 (在PubMed

]

文摘

科学家发明了一个协议,允许蛋白质识别使用可用的dna或蛋白质序列从参考株菌种为之前没有扩展到菌株dna或蛋白质序列信息的存在。协议是基于仔细的特定亚细胞蛋白质组的分离。在这项研究中,核糖体蛋白质是由于他们的高拷贝数每个细胞相对丰度和相似性。隔离的核糖体蛋白质后,MALDI-MS用于获取准确的蛋白质的分子量。迭代的比较参考蛋白质分子量和身份是结果数据,允许直接从任何非引用菌株核糖体蛋白质的识别。这种方法可以揭示差异氨基酸或蛋白质翻译后水平。协议开发、验证和应用于核糖体蛋白从三个菌株的极端嗜热生物栖热菌属酸奶。这种方法显示,近60%的核糖体蛋白质从所有三个菌株是相同的。扩展的蛋白质识别额外的菌株可用于系统发育研究以及生物标志物识别。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
50年代L27核糖体蛋白质	P60493	细节
30年代S10核糖体蛋白质	Q5SHN7	细节
30年代S12核糖体蛋白质	Q5SHN3	细节
30年代S11核糖体蛋白质	P80376	细节
30年代核糖体蛋白向	P80377	细节
30年代S15核糖体蛋白质	Q5SJ76	细节
30年代S16核糖体蛋白质	Q5SJH3	细节
30年代S18核糖体蛋白美国	Q5SLQ0	细节
30年代S19核糖体蛋白质	Q5SHP2	细节
30年代S20核糖体蛋白质	P80380	细节
30年代核糖体蛋白S4	P80373	细节
30年代核糖体蛋白S5	Q5SHQ5	细节
30年代核糖体蛋白S6	Q5SLP8	细节
30年代S7核糖体蛋白质	P17291	细节
30年代核糖体蛋白S9	P80374	细节
30年代Thx核糖体蛋白质	Q5SIH3	细节
30年代核糖体蛋白S3	P80372	细节
30年代核糖体蛋白Z S14系列类型	P0DOY6	细节
30年代核糖体蛋白肌力	P0DOY7	细节
30年代S8核糖体蛋白质	P0DOY9	细节