机制产品链长度的决心和一个灵活的角色在大肠杆菌undecaprenyl-pyrophosphate合成酶催化循环。
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Ko TP,陈YK,罗宾逊H,蔡PC,梁高YG,陈美联社,王啊,PH
机制产品链长度的决心和一个灵活的角色在大肠杆菌undecaprenyl-pyrophosphate合成酶催化循环。
生物化学杂志。2001年12月14日,276 (50):47474 - 82。Epub 2001年10月1日。
- PubMed ID
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11581264 (在PubMed]
- 文摘
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大肠杆菌undecaprayl-pyrophosphate合成酶(UPPs)结构解决了使用单波长反常衍射方法。假定的substrate-binding站点附近的betaA-strand Asp-26扮演一个关键的催化作用。在这两个单元,一个细长的疏水隧道是发现,周围四个beta-strands (betaA-betaB-betaD-betaC)和两个螺旋(alpha2和alpha3),底部有大量残留ile - 62,亮氨酸- 137,val - 105, - 103。产品分布由使用I62A, V105A, H103A突变体是野生型UPPs所观察到的类似。催化L137A UPPs,另一方面,导致主要C(70)聚合物的形成而不是C(55)聚合物。阿拉巴马州ala - 143 - 69和隧道的顶部附近。A143V反应相比,C(30)中间形成更大程度上,再住在A69L突变体的催化过程。这些发现表明,阿拉巴马州的小侧链- 69需要快速伸长C(55)产品,而大的疏水侧链所需要的低浓缩铀- 137是极限伸长到C(55)的产品。残留的角色位于一个灵活的循环了。S71A N74A,或R77A突变体显示25 - 200倍降低k (cat)值。 W75A showed an 8-fold increase of the FPP K(m) value, and 22-33-fold increases in the IPP K(m) values were observed for E81A and S71A. The loop may function to bridge the interaction of IPP with FPP, needed to initiate the condensation reaction and serve as a hinge to control the substrate binding and product release.