衬底绑定模式和反应机理的undecaprenyl焦磷酸合成酶推断从晶体研究。
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Chang SY,陈Ko TP,美联社,王啊,梁的PH值
衬底绑定模式和反应机理的undecaprenyl焦磷酸合成酶推断从晶体研究。
蛋白质科学。2004年4月,13 (4):971 - 8。
- PubMed ID
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15044730 (在PubMed]
- 文摘
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Undecaprenyl焦磷酸合成酶(UPPs)催化8连续缩合的反应通过焦磷酸(FPP) isopentenyl焦磷酸(IPP)形成55-carbon长链的产品。我们之前报道的晶体结构从大肠杆菌酶朊UPPs在复杂的结构和硫酸盐离子(类似焦磷酸盐基质),镁(2 +),和两个Triton分子(一类的产品)。在目前的研究中,FPP衬底被浸泡到UPPs晶体,解决了复杂结构。基于晶体结构、焦磷酸组负责人FPP必然会的骨干NHs Gly29 Arg30以及Asn28的侧链,Arg30, Arg39通过氢键。His43接近FPP和可能的C2碳稳定通过阳离子在催化中间。FPP必然的碳氢化合物一部分疏水氨基酸包括Leu85 Leu88, Phe89,位于alpha3螺旋。FPP的绑定模式cis-type UPPs显然不同于trans-type和许多其他prenyltransferases利用Asprich图案衬底绑定通过镁(2 +)。新结构提供了一个合理的机制来暴的催化作用。