RNA聚合酶抑制剂“开关区域”是一个目标。

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Mukhopadhyay J, K Das,伊斯梅尔年代,Koppstein D,张成泽M,哈德逊B, Sarafianos年代,Tuske年代,Patel J,詹森R, Irschik H,阿诺德E, Ebright RH

RNA聚合酶抑制剂“开关区域”是一个目标。

细胞。2008年10月17日,135 (2):295 - 307。doi: 10.1016 / j.cell.2008.09.033。

PubMed ID
18957204 (在PubMed
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文摘

alpha-pyrone抗生素myxopyronin (Myx)抑制细菌RNA聚合酶(RNAP)。这里,通过结合遗传、生化和结构方法,我们表明,Myx与RNAP交互“切换地区”——介导的铰链开启和关闭RNAP活性中心的间隙,防止RNAP与启动子基因的相互作用。我们定义Myx之间的联系和RNAP Myx在RNAP构象的影响和建议Myx功能通过干扰的RNAP活性中心在转录起始间隙。我们进一步证明相关的结构alpha-pyrone抗生素corallopyronin(软木)和结构无关的macrocyclic-lactone抗生素ripostatin Myx (Rip)函数近似地。RNAP开关区域远离以前的目标特征RNAP抑制剂,而且,相应地,Myx,软木,Rip不展览crossresistance与以前描述的RNAP抑制剂。RNAP开关地区是一个有吸引力的目标识别新广谱抗菌药物。

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RNA聚合酶SigAσ因子 Q5SKW1 细节