转录RNA聚合酶的失活通过当地重折叠结构。
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Belogurov GA, Vassylyeva MN, Sevostyanova阿普曼JR,湘AX,里拉R,韦伯,Klyuyev年代,Nudler E, Artsimovitch我Vassylyev DG
转录RNA聚合酶的失活通过当地重折叠结构。
自然。2009年1月15日,457 (7227):332 - 5。doi: 10.1038 / nature07510。Epub 2008年10月22日。
- PubMed ID
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18946472 (在PubMed]
- 文摘
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抗生素的结构研究不仅提供了一个捷径医学允许合理的基于结构的药物设计,但也可以捕捉动态的中间体,成为“冻结”的快照抑制剂后绑定。Myxopyronin抑制细菌RNA聚合酶(RNAP)一个未知的机制。在这里,我们报告的结构dMyx——desmethyl导数myxopyronin B与栖热菌属混合酸奶RNAP全酶。抗生素结合口袋深处RNAP夹头域,这与转录DNA模板的泡沫。值得注意的是,绑定dMyx稳定重折叠的β亚基开关2段,导致配置可能会间接影响绑定,或者直接冲突,熔化的模板DNA链。一致,碳足迹数据显示,抗生素绑定并不妨碍成核的启动子DNA融化,而是阻止其传播向活性部位。Myxopyronins因此,据我们所知,第一个结构特征类的抗生素,目标形成pre-catalytic转录起始的复杂的基因表达控制的决定性的一步。值得注意的是,突变设计开关2模拟dMyx对启动子复合物在没有抗生素的影响。总体而言,我们的研究结果表明合理dMyx行动机制,逐步开放复杂的途径形成的核心酶介导的最后阶段DNA转录起始站点附近融化,开关2可能作为DNA分子检查点加载响应监管信号或抗生素。普遍的守恒的开关2可能有相同的作用在所有multisubunit RNAPs。