DNA识别由p53揭示晶体结构的多样性与Hoogsteen碱基对。
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Kitayner M, Rozenberg H, Rohs R,萨阿德O,拉比诺维奇D,韩起澜B, Shakked Z
DNA识别由p53揭示晶体结构的多样性与Hoogsteen碱基对。
Nat Struct杂志。2010年4月17日(4):423 - 9。doi: 10.1038 / nsmb.1800。Epub 2010年4月4。
- PubMed ID
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20364130 (在PubMed]
- 文摘
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p53结合作为DNA的四聚物目标组成的两个decameric half-sites间隔隔开一个变量。这里我们提出高分辨率的晶体结构之间的复合物p53核心领域四聚体和DNA组成的连续的half-sites目标。与之前报道p53-DNA复合物显示标准的沃森克里克碱基对,新报告的结构显示经典之中Hoogsteen碱基对几何在中央一个t每个half-site的紧身上衣。几何结构和计算分析表明,Hoogsteen明显调节B-DNA螺旋的当地的形状和静电势,连续的DNA一起配置,导致增强protein-DNA和蛋白质相互作用而非邻接half-sites。我们的结果显示一个间隔长度protein-DNA绑定关联相关的机制。我们的发现也扩大当前的protein-DNA识别和理解建立Hoogsteen碱基对的结构和化学性质作为一种新型的基础模式顺序读出。