pUB110的核苷酸序列:复制关系中的一些重要特性及其调节。
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麦肯齐T,田中Hoshino T, T, Sueoka N
pUB110的核苷酸序列:复制关系中的一些重要特性及其调节。
质粒。1986年3月,15 (2):93 - 103。
- PubMed ID
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3010356 (在PubMed]
- 文摘
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研究DNA-membrane交互和复制起始的规定我们已经确定的总pUB110核苷酸序列。之前报道,这在枯草芽孢杆菌质粒复制拷贝数的30 - 50 /细胞,与大多数质粒(60 - 80%)绑定到膜(i型绑定)。i型膜绑定显然pUB110启动体内的复制所必需的,但膜结合位点是不清楚。此外,质粒的四个方面具体结合枯草芽孢杆菌在体外膜结合反应(II型绑定)。这两种膜结合pUB110体内不同的绑定(i型)需要一个主机(dnaBI)启动基因和耐高盐,而体外绑定(ⅱ型)不需要dnaBI基因产物和高盐敏感。7-mer双链序列,TCAGCAA / AGTCGTT,或衍生品的单碱基序列经常7-mer序列的23(17)中发现的或接近二型绑定的地区。其中之一是发现在限制性内切酶识别位点的绑定,破坏了ⅱ型膜绑定。这些序列可能有也可能没有意义二型膜绑定。除了新霉素抗性基因,序列数据显示两个相当大的开放阅读框架,ORFα和β羊痘疮,和两个小ORF,γ和δ。所有这些阅读框架在同一个方向,这与复制的方向一致。 The open reading frame alpha (ORF alpha) corresponding to 334 amino acids close to the replication origin may be essential for the initiation of replication of PUB110. The putative protein alpha corresponding to this open reading frame contains a consensus sequence of the DNA binding sites which are found in a number of known DNA-binding proteins. The consensus DNA binding site of protein alpha is flanked by two hydrophobic areas. These two observations suggest that the corresponding protein may have both an affinity to a specific site in pUB110, and an affinity to the membrane.