将5-HT(3)受体配体结合域的残基映射到d-tubocurarine结构上。
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Yan D, Meyer JK, White MM
将5-HT(3)受体配体结合域的残基映射到d-tubocurarine结构上。
《Mol Pharmacol》2006年8月;70(2):571-8。Epub 2006年5月24日。
- PubMed ID
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16723497 (PubMed视图］
- 摘要
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血清素5-HT(3)受体(5-HT(3)R)是cyys -loop配体门控离子通道家族的成员。我们使用了位点定向突变、5-HT(3)R细胞外结构域的同源性建模和配体对接模拟相结合的方法来映射5-HT(3)R配体结合结构域的结构。酪氨酸结合位点C环Phe226的突变(F226Y)对竞争性拮抗剂d-tubocurarine (dTC)对该受体的表观亲和力没有影响。另一方面，用丙氨酸(N128A)替换结合位点A环上的Asn128可使dTC的表观亲和力增加约10倍。双突变周期分析表明，Asn128与dTC类似物的2′n直接相互作用，dTC类似物与Asn128的2′n直接相互作用。5-HT(3)R细胞外结构域的分子建模使用加利福尼亚海兔乙酰胆碱结合蛋白的拮抗剂结合构象作为模板，然后配体对接模拟产生两类5-HT(3)R/dTC复合物的结构;其中只有一个dTC的2n位于Asn128，因此与本研究的数据和先前发表的数据一致。使用刚性dTC类似物作为“分子标尺”，结合突变受体的双突变周期分析，可以对配体结合位点上的各种残基位置进行空间映射。