耦合的光致电子转移和质子吸收来自晶体结构的反应中心Rhodopseudomonas viridis修改二级醌的结合位点,QB。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
兰开斯特CR,米歇尔·H
耦合的光致电子转移和质子吸收来自晶体结构的反应中心Rhodopseudomonas viridis修改二级醌的结合位点,QB。
结构。1997年10月15日,5 (10):1339 - 59。
- PubMed ID
-
9351808 (在PubMed]
- 文摘
-
背景:在一个反应中心重要的光合细菌的能量,光致电子转移反应中心(RC)耦合的吸收质子从细胞质中结合位点的二级醌(QB)。原结构的RC Rhodopseudomonas viridis (PDB项代码1中华人民共和国)、QB网站定义得很差,因为在标准的RC晶体只有大约30%忙于ubiquinone-9 (UQ9)。我们报告的结构表征QB网站UQ9-depleted RCs的晶体细化和复合物的RC与ubiquinone-2 (UQ2)或电子转换抑制剂stigmatellin QB的网站。结果:与UQ2钢筋混凝土的结构复杂,精致的分辨率2.45,构成第一结晶学可靠的定义结合位点的醌类bioenergetically重要醌池的生物,energy-transducing膜。UQ9-depleted QB网站的钢筋混凝土结构,精炼分辨率2.4,显然五(并且可能6)水分子绑定而不是泛醌组负责人和洗涤剂分子结合在该地区的类异戊二烯的尾巴。protein-cofactor交互涉及泛醌头组的绑定也涉及stigmatellin头组的绑定。stigmatellin-RC的结构复杂、雅致的分辨率2.4,额外的氢键稳定泛醌的stigmatellin的绑定。UQ9的试探性的位置在QB网站原始数据集(1)中华人民共和国)审查使用UQ9-depleted RC结构作为参考。修改QB网站模式,表现出更大的相似性远端ubiquinone-10 (UQ10)定位在钢筋混凝土的结构从Rhodobacter sphaeroides (PDB项代码1 pcr),建议作为本地UQ9占主导地位的结合位点。结论:本篇报告的结构可以提供型号的醌还原循环中间体。 The binding pattern observed for the stigmatellin complex, where the ligand donates a hydrogen bond to Ser L223 (where 'L' represents the L subunit of the RC), can be viewed as a model for the stabilization of a monoprotonated reduced intermediate (QBH or QBH-). The presence of Ser L223 in the QB site indicates that the QB site is not optimized for QB binding, but for QB reduction to the quinol.