从Rhodopseudomonas viridis精制反应中心的晶体结构与除草剂阿特拉津和两个手性配合物阿特拉津也衍生品导致绑定类胡萝卜素的一种新的模式。
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引用
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兰开斯特CR,米歇尔·H
从Rhodopseudomonas viridis精制反应中心的晶体结构与除草剂阿特拉津和两个手性配合物阿特拉津也衍生品导致绑定类胡萝卜素的一种新的模式。
J杂志。1999年2月26日,286 (3):883 - 98。
- PubMed ID
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10024457 (在PubMed]
- 文摘
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反应的重要性对光合细菌的能量,光致电子转移反应中心(RC)加上吸收质子从细胞质中结合位点的二级醌(QB)。它已经建立了x射线晶体学,三嗪除草剂去草净结合QB站点。然而,protein-triazine交互的确切描述不得不等待高分辨率结构的改进。此外,还有兴趣活动的手性除草剂的作用。在这里,我们报告三嗪的结构描述绑定通过配合物的晶体细化RC与三嗪抑制剂阿特拉津(蛋白质数据库(PDB)条目5 prc)或手性阿特拉津的衍生品,dg - 420314 (S(-)对映体,PDB项6 prc)或dg - 420315 (R(+)对映体,PDB项7中华人民共和国)。由于高质量的数据收集,它已经可以描述三嗪绑定的确切性质及其对蛋白质结构的影响在高分辨率的极限2.35中国(5),(6中华人民共和国),2.30和2.65(7中华人民共和国),分别。除了两个先前隐含氢键,第三个氢键,绑定的远端一侧蛋白抑制剂,和四个额外的水分子氢键由两个紧密地绑定在近端一侧的抑制剂,是显而易见的。基于高质量数据收集RC复合物的两个手性阿特拉津的衍生品,明确的任务结构的手性中心是可能的,即使取代基的结构差异很小。结构提供解释的相对结合亲和力两个手性化合物。虽然它不是一个明确的目标,这项工作,足够的新数据质量改善原始模型还对绑定类胡萝卜素的结构1,2-dihydroneurosporene。 A carotenoid model with a cis double bond at the 15,15' position fits the electron density better than the original model with a 13,14-cis double bond.