外科人类大肠癌组织蛋白质组表达分析:PSB7老年病,PRDX1, SRP9和低氧适应癌症。
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ρJH,秦年代,王司法院,Roehrl MH
外科人类大肠癌组织蛋白质组表达分析:PSB7老年病,PRDX1, SRP9和低氧适应癌症。
J蛋白质组研究》2008年7月,7 (7):2959 - 72。doi: 10.1021 / pr8000892。Epub 2008年6月13日。
- PubMed ID
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18549262 (在PubMed]
- 文摘
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结直肠腺癌是全世界癌症死亡的主要原因之一。发现特定的生物标记物早期发现癌症的进展和识别潜在的致病的机制是重要的任务。迄今为止全球蛋白质组学方法的大动态范围的限制分子浓度的组织和缺乏选择性富集low-abundance蛋白质组。我们研究配对癌临床组织标本和正常结直肠患者腺癌,肝素亲和分离浓缩(HAFE)其次是二维页面和串联质谱(MS / MS)鉴定。五十六个差异表达蛋白质被发现,其中32 low-abundance蛋白质只有肝素亲和富集后检测。MS / MS是用来识别5选择差异表达蛋白质作为蛋白酶体β亚基类型7 (PSB7)、血红蛋白α亚基(HBA) peroxiredoxin-1 (PRDX1) argininosuccinate合成酶(装配),和信号识别颗粒9 kDa蛋白质(SRP9)。这是第一个蛋白质组研究检测这些蛋白质在人类的微分表达式结直肠癌组织中。几个相关的蛋白质功能组织缺氧和缺氧的适应。PSB7的相对特异性,PRDX1 SRP9超表达在结肠癌研究结肠腺癌患者的免疫印迹分析和比较控制队列的肺腺癌患者。此外,免疫组织化学组织部分是用来定义PSB7的特定位置,PRDX1, SRP9老年病内异构主要人类肿瘤组织。 Overexpression of the three proteins was restricted to the neoplastic cancer cell population within the tumors, demonstrating both cytoplasmic and nuclear localization of PSB7 and predominantly cytoplasmic localization of PRDX1 and SRP9. In summary, we describe heparin affinity fractionation enrichment (HAFE) as a prefractionation tool for the study of the human primary tissue proteome and the discovery of PSB7, PRDX1, and SRP9 up-regulation as candidate biomarkers of colon cancer.