全基因组的比较结核分枝杆菌临床和实验室菌株。
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全基因组的比较结核分枝杆菌临床和实验室菌株。
J Bacteriol。2002年10月,184 (19):5479 - 90。
- PubMed ID
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12218036 (在PubMed]
- 文摘
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毒性和免疫在结核分枝杆菌知之甚少。我们的完整基因组测序结核分枝杆菌临床菌株CDC1551与实验室进行了全基因组比较应变H37Rv为了识别多态序列与潜在相关性疾病发病机理,免疫力,与进化。我们发现large-sequence,在众多基因单核苷酸多态性。多态位点包括磷脂酶C、膜脂蛋白,腺苷酸环化酶基因家族的成员,和PE / PPE基因家族的成员,其中一些涉及毒性或宿主的免疫反应。几个基因家族,包括PE / PPE基因家族,也明显高于同义和产生的替换频率相对于整个基因组。我们测试了结核分枝杆菌临床分离株的大样本的一个子集large-sequence和单核苷酸多态性,发现广泛的遗传变异在这些位点。我们进行了系统调查和流行病学分析的起源进化分离株之间的关系和具体的多态位点。许多这些多态性似乎已经发生多次独立事件,这表明这些变化可能是选择性压力下。在一起,这些结果说明多态性在结核分枝杆菌菌株比最初预期的更广泛,和遗传变异可能在疾病发病机制和免疫有重要的作用。