由磷酸脲酶抑制:小说的基于结构的合理化见解酶机制。
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Benini年代,Rypniewski WR,威尔逊KS Ciurli年代,Mangani年代
由磷酸脲酶抑制:小说的基于结构的合理化见解酶机制。
J Inorg化学杂志。2001;10月6 (8):778 - 90。
- PubMed ID
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11713685 (在PubMed]
- 文摘
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巴氏芽孢杆菌的结构解决了磷酸脲酶(BPU)抑制和精制使用同步加速器从陶瓷晶体x射线衍射数据(分辨率1.85,99.3%的完整性,数据冗余4.6 r因子17.3%,PDB代码6 ubp)。3.5的距离分开的两个镍离子在活性部位。抑制剂的绑定模式的形成四个协调债券涉及两个镍离子:磷酸一个氧原子对称桥的两个金属离子(1.9 - -2.0),磷酸,剩余的两个氧原子结合镍原子在2.4。第四个磷酸氧是直接进入活动网站频道。在绑定抑制剂H-bonding网络的分析表明,磷酸势必H2PO4 -阴离子,这额外的Odelta2原子的质子存在Asp (alpha363),一个活跃的站点通过Odelta1残留倪参与协调。灵活的皮瓣在活性部位腔侧面开放构型。复杂的分析揭示了为什么磷酸硫酸是一个相对较弱的抑制剂,为什么不绑定到硬币的活性部位。结果的意义理解的脲酶催化机理进行了综述。另一本小说的质子给予体。