从栖热菌属Multi-site-specific 16 s rRNA甲基转移酶RsmF酸奶。
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Larsen LH Demirci H,汉森T,拉斯穆森,使一个,Gregory圣Kirpekar F, Jogl G
从栖热菌属Multi-site-specific 16 s rRNA甲基转移酶RsmF酸奶。
RNA。2010年8月,16 (8):1584 - 96。doi: 10.1261 / rna.2088310。Epub 2010年6月17日。
- PubMed ID
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20558545 (在PubMed]
- 文摘
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细胞向多个修改的生产投入很大的精力核糖体rna的核苷酸,微调核糖体的功能。在这里,我们报告两个甲基转移酶,RsmB RsmF,负责所有四个5-methylcytidine (m (5) C)修改16 s rRNA栖热菌属的酸奶。像大肠杆菌RsmB, t .酸奶RsmB产生m (5) C967。与大肠杆菌RsmF相比,它引入了一个m (5) C1407修改,t .酸奶RsmF修改三个位置,产生m (5) C1400和m (5) C1404除了m (5) C1407。这三个残留物都聚集在解码的核糖体,但位于不同的结构情况下,建议要求灵活性RsmF活性部位缺席大肠杆菌的酶。两个这些残留物,C1400 C1404,足够埋在成熟的核糖体结构,需要访问的广泛展开rRNA RsmF。体外,t .酸奶RsmF混入甲醇C1400, C1404,和C1407 30 s亚基衬底,但是只有C1400 C1404裸露出16 s rRNA衬底。t .酸奶的multispecificity RsmF可能解释为三个酶的晶体结构复杂的代数余子式S-adenosyl-methionine高达1.3的决议。除了确认整体结构相似性RsmF大肠杆菌,这些结构也显示,关键领域活跃的网站可能是动态的解决方案,从而扩大底物识别由t .酸奶RsmF。