基质金属蛋白酶的构象变化:在一个三维结构。

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贝尔蒂尼我回复中V,科森扎米,Fragai M,李YM, Luchinat C, Mangani年代,特尔尼B, Turano P

基质金属蛋白酶的构象变化:在一个三维结构。

《美国国家科学院刊S a . 2005年4月12日;102 (15):5334 - 9。Epub 2005年4月4。

PubMed ID

15809432 (在PubMed

]

文摘

基质金属蛋白酶的催化结构域12 acetohydroxamic酸和N-isobutyl-N - [4-methoxyphenylsulfonyl]氨基乙酰基异羟肟酸已经解决了x射线衍射的结晶状态在1.0和1.3 a分辨率,分别与以前公布的x射线结构与batimastat 1.2 a分辨率的加合物。N-isobutyl-N的结构——[4-methoxyphenylsulfonyl]氨基乙酰基异羟肟酸加合物已经解决了NMR在解决方案。三个x射线结构和解决方案结构相似但不完全相同,是做高的差异循环。我们建议,许多循环显示解决方案在各种时间尺度的动力学行为。不同蛋白质的构象一些灵活的区域可以观察到“冻结”在不同的结晶环境。机动性在溶液中研究了核磁共振显示构象平衡在访问时间尺度,即。女士从10(5)年代,等等。平均剩余的偶极耦合是一致的进一步动作10 (9)s。最后,当地每个冷冻构象的热运动在100 K的结晶状态关联与当地运动在皮秒时间尺度。灵活性/构象异构催化域的关键部分是规则,而不是例外,基质金属蛋白酶及其程度可能被低估的检查一个x射线结构。骨干的灵活性可能发挥作用在选择性抑制剂设计中遇到的困难,而这可能是一个必要的衬底绑定和广泛的底物特异性。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Acetohydroxamic酸	巨噬细胞metalloelastase	蛋白质	人类	未知的	抑制剂	细节