非甾体抗炎药是有效的磷脂酶A2抑制剂:结构复杂的磷脂酶A2与尼氟酸2.5埃分辨率。
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辛格Jabeen T, N,辛格RK,沙玛,Somvanshi RK,戴伊年代,辛格TP
非甾体抗炎药是有效的磷脂酶A2抑制剂:结构复杂的磷脂酶A2与尼氟酸2.5埃分辨率。
Acta Crystallogr D Crystallogr杂志。2005年12月,61 (Pt 12): 1579 - 86。Epub 2005年11月19日。
- PubMed ID
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16301791 (在PubMed]
- 文摘
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磷脂酶(2)(人民解放军(2);EC 3.1.3.4)催化第一步的促炎的化合物统称为类花生酸的生产。绑定的磷脂基质通过形成良好的解放军(2)发生疏水通道。表面等离子体共振的研究表明,尼氟酸结合眼镜蛇眼镜蛇sagittifera解放军(2)具有亲和力,对应于一个离解常数(K (d)) 4.3 x 10(5)和m .绑定的研究解放军(2)尼氟酸也使用一个标准的中国人民解放军(2)工具,给出了一个近似的结合常数,K (i), 1.26 + / - 0.05 x 10 (6) m .因此,为了建立的可行性解放军(2)作为一个潜在的目标分子药物设计与炎症、关节炎和风湿病,解放军的复杂的三维结构(2)与已知抗炎剂尼氟酸[2 - (3 - (trifluoromethyl)苯胺基)烟酸)已被确定为2.5埃分辨率。复杂的结构已经被精炼R因子为0.187。确定结构揭示了存在一个尼氟酸分子的substrate-binding解放军(2)。这表明尼氟酸与重要的活性部位残留His48和交互Asp49通过两个水分子。可以看出尼氟酸分子完全埋在substrate-binding疏水通道。结合位点的构象在解放军(2)以及尼氟酸不改变绑定。然而,Trp19的侧链的取向,这是位于substrate-binding网站的入口,已经改变了从发现本地人民解放军(2),表明其熟悉的角色。