植物共生体的完整基因组序列的荧光假单胞菌Pf-5。
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Paulsen它,按厘米,拉威尔J,小林DY,迈尔斯GS, Mavrodi DV, DeBoy RT,瑟哈德里R,任Q, Madupu R,道森RJ, Durkin, Brinkac LM,多尔蒂SC,沙利文SA Rosovitz MJ, Gwinn ML,周L,施耐德DJ, Cartinhour西南,纳尔逊WC,韦德曼J,沃特金斯K, Tran K,艺H,皮尔森EA,皮尔森LS 3日,托马斯休LS,洛佩尔我
植物共生体的完整基因组序列的荧光假单胞菌Pf-5。
生物科技Nat》。2005年7月23日(7):873 - 8。Epub 2005年6月26日。
- PubMed ID
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15980861 (在PubMed]
- 文摘
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荧光假Pf-5是栖息在根际植物共生的细菌,产生次生代谢产物抑制土著植物病原体。基因组的完整序列7.1 mb Pf-5决心。我们重复序列进行分析,以确定基因组岛,与其他方法一起,建议p .荧光Pf-5最近的横向并购包括六个次生代谢基因簇,七个噬菌体区域和一个移动基因组岛。我们确定了各种特性,导致其对植物的共生体的生活方式,包括广泛的分解和运输能力利用植物的化合物,明显能够使用铁含铁细胞的多样性,从氧化应激解毒系统保护,缺乏III型分泌系统和毒素相关病原体。除了6个已知p .荧光产生的次生代谢物Pf-5,三个新颖的次生代谢产物生物合成基因簇还确认,可能导致生物防除属性的p .荧光Pf-5。