Inhibitor-bound人类丙酮酸脱氢酶激酶4的结构。
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Kukimoto-Niino M, Tokmakov田农T, Ohbayashi N,藤本T,无味,Shiromizu我川M, Matsusue T,是M, Yokoyama年代
Inhibitor-bound人类丙酮酸脱氢酶激酶4的结构。
Acta Crystallogr D Crystallogr杂志。2011年9月,67 (Pt 9): 763 - 73。doi: 10.1107 / S090744491102405X。Epub 2011年8月9日。
- PubMed ID
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21904029 (在PubMed]
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线粒体丙酮酸脱氢酶复合体(PDC)催化丙酮酸的氧化脱乙酰辅酶a。PDC活动严格监管四个家庭成员的丙酮酸脱氢酶激酶(PDK1-4),这使磷酸化和灭活PDC。最近,PDK4的特定抑制剂的发展已经成为一个焦点尤其重要的医药管理糖尿病和肥胖。在这项研究中,晶体结构的人类PDK4 AMPPNP包裹着,ADP或抑制剂M77976下定了决心。ADP-bound PDK4稍微更广泛的活性部位间隙和更为无序ATP盖子与AMPPNP-bound PDK4,虽然两种形式PDK4假设与更广泛的公开构象活性部位间隙比之前报道的封闭的构象ADP-bound PDK2结构。M77976 PDK4腺苷结合口袋的结合,并导致局部构象变化完全无序化的ATP盖子。M77976绑定也会导致一个大域重排进一步扩展了PDK4的活性部位间隙与ADP和AMPPNP-bound形式。生化分析表明M77976抑制PDK4增加效能与以前相比此后抑制剂radicicol特点。因此,目前的结构展示首次PDK4的灵活和动态方面的开放构型,并提供一个基础的发展新型抑制剂针对PDK4 nucleotide-binding口袋。