酶催化在大肠杆菌麦芽糊精磷酸化酶晶体。

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Geremia年代,Campagnolo M, Schinzel R,约翰逊LN

酶催化在大肠杆菌麦芽糊精磷酸化酶晶体。

J杂志。2002年9月13日,322(2):413 - 23所示。

PubMed ID

12217700 (在PubMed

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麦芽糊精的细菌酶磷酸化酶(MalP)催化作用的磷酸解alpha -, 4-glycosidic债券在麦芽糖糊精,删除非还glucosyl残留的线性低聚糖作为glucose-1-phosphate (Glc1P)。相比之下研究肌肉糖原磷酸化酶(GP), MalP展品没有变构性质和具有较高的亲和力线性比医生低聚糖。我们使用MalP作为一个模型系统研究催化合成水晶麦芽糊精的方向。2.0 MalP / Glc1P二进制复杂的晶体结构表明,Glc1P衬底采用构象看到以前不活跃和积极形式的哺乳动物医生,与磷酸基不是在密切接触的5 '磷酸组基本磷酸吡哆醛(PLP)代数余子式。活跃MalP酶的残留Arg569稳定的负电荷Glc1P,而在医生这个关键的不活跃的形式残留举行远离280年代由循环催化部位和哺乳动物的酶的变构转变需要激活。表明His377 MalP结构之间的比较,通过氢键与6-hydroxyl群Glc1P衬底,触发一个380年代的构象改变循环。这个移动区域折叠催化部位,有助于识别特定的低聚糖和基质之间的合作在促进MalP三元复合物的形成。结构解决了扩散后的低聚糖(maltotetraose、G4或maltopentaose G5)到MalP / Glc1P晶体磷酸的形成和寡糖链的伸长。这些结构、雅致的1.8和2.2,确认只有一个低聚糖是绑定到催化网站Glc1P弯曲磷酸基失望,所以它可以联系领导,5 '磷酸基,促进催化。相对较大的低聚糖基质可以迅速扩散到MalP / Glc1P晶体,晶体可能发生酶促反应没有显著损伤。 These structures obtained before and after catalysis have been used as frames of a molecular movie. This movie reveals the relative positions of substrates in the catalytic channel and shows a minimal movement of the protein, involving mainly Arg569, which tracks the substrate phosphate group.

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
磷酸吡哆醛	糖原磷酸化酶、肌肉的形式	蛋白质	人类	未知的	代数余子式	细节