比较序列分析在人类和小鼠MECP2-locus揭示新的转录区域。
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Reichwald K, Thiesen J, Wiehe T, Weitzel J, Poustka佤邦,罗森塔尔,是M, Stratling WH, Kioschis P
比较序列分析在人类和小鼠MECP2-locus揭示新的转录区域。
Mamm基因组。2000年3月,11 (3):182 - 90。
- PubMed ID
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10723722 (在PubMed]
- 文摘
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比较序列分析有助于确定进化保守区域,也就是说,基因调控元素,不能仅通过分析一个物种被发现。人类染色体测序152 kb的地区(杆)中Xq28和synthenic 123 kb的鼠标XC MECP2 / MECP2轨迹,从而向两侧的基因编码受体相关的激酶(伊拉克共和国/ Il1rak)和红色的视蛋白基因(RCP /回复)。通过比较序列分析,我们发现了一个前所未知的,非编码5 '外显子嵌入CpG岛与MECP2 / MECP2有关。因此,MECP2 / MECP2基因组成的四个外显子,而不是三个。此外,序列比较3 '之前报道聚腺苷酸化信号显示一个高度保守的区域8.5 kb终止的一个替代聚腺苷酸化的信号。北部污点分析验证的存在两个主要记录1.9 kb和大约10 kb,分别。两个成绩单展览组织表达模式和几乎相同的短半衰期。约10 kb记录中包含对应于一个巨大的3 ' UTR MECP2的第四个外显子。长3 ' UTR和新发现的第一个内含子的MECP2在人类和小鼠/ MECP2是高度保守的。此外,人类的MECP2轨迹是异构的DNA组成。 We postulate that it represents a boundary between two H3 isochores that has not been observed previously.