结构和动力学的单功能的脯氨酸脱氢酶从栖热菌属酸奶。

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白色的助教,Krishnan N,贝克尔DF,坦纳JJ

结构和动力学的单功能的脯氨酸脱氢酶从栖热菌属酸奶。

生物化学杂志。2007年5月11日,282(19):14316 - 27所示。Epub 2007年3月7日。

PubMed ID

17344208 (在PubMed

]

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脯氨酸脱氢酶(PRODH)和三角洲(1)-pyrroline-5-carboxylate脱氢酶(P5CDH)催化的两步氧化脯氨酸谷氨酸。他们不同的单功能的酶在所有真核生物和一些细菌,但融合成双功能酶称为脯氨酸利用率(婊子)的其他细菌。在这里,我们报告的第一个结构和生化数据单功能的PRODH。栖热菌属的2.0 a分辨率结构酸奶PRODH揭示了一个扭曲的(betaalpha)(8)桶催化核心域和一个疏水α螺旋域上方的羧基末端的链的桶。虽然催化核心的贱人PRODH域相似,t .酸奶的时尚构象PRODH非常不同,可能反映了独特的要求与P5CDH膜协会和沟通。的时尚t .酸奶PRODH高度solvent-exposed与贱人由于螺旋8 4转变。小贱人/ PRODH家族的序列分析使我们确定九守恒的代数余子式和底物识别所涉及的主题。生化研究表明,时尚是-75 mV的中点电位和脯氨酸的动力学参数K (m) = 27毫米和K (cat) = 13 (1)。3,4-Dehydro-l-proline被发现一个有效的衬底,l-tetrahydro-2-furoic酸是一个竞争性抑制剂(K (I) = 1.0毫米)。最后,我们证明了t .酸奶PRODH与O(2)反应生成过氧化物。 This is significant because superoxide production underlies the role of human PRODH in p53-mediated apoptosis, implying commonalities between eukaryotic and bacterial monofunctional PRODHs.

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
脯氨酸	脯氨酸脱氢酶1,线粒体	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节