人质膜钙泵基因可选剪接选项的定量分析。
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Stauffer TP, Hilfiker H, Carafoli E, Strehler EE
人质膜钙泵基因可选剪接选项的定量分析。
生物化学杂志。1993 12月5日;268(34):25993-6003。
- PubMed ID
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8245032 (查看PubMed］
- 摘要
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以甘油醛-3-磷酸脱氢酶为内标，对逆转录mRNA进行定量聚合酶链式反应，分析了目前已知的4个人质膜钙泵(PMCA)基因在7个组织(大脑皮层、骨骼和心肌、胃、肝、肺、肾)中的备选剪接选项和转录本的组织定量分布。基因1和4的mrna在所有组织中表达量相似，而基因2和3的转录本则以组织特异性的方式表达，即在胎儿骨骼肌和大脑中表达量最高。在PMCA转录本的两个主要调控位点(A和C位点)上发现了选择性剪接，它们分别位于氨基端磷脂反应区附近和羧基端钙调蛋白结合域内。在人类基因的A位点检测到hPMCA3和4，在c位点检测到hPMCA1、2和3，在所有基因的两个剪接位点都发现了一个共同的剪接变异。A位点常见的剪接变异的特征是包含一个小的外显子(hPMCA1, 39个碱基对(bp);hPMCA2, 42 bp;hPMCA3, 42 bp;hPMCA4, 36 bp)。在C位点常见的剪接变异中，有一个外显子(hPMCA1, 154 bp;hPMCA2, 227 bp; hPMCA3, 154 bp; hPMCA4, 178 bp) was excluded in the mRNA. All genes normally express these main splice variants in all tissues in which the corresponding isoform is present. The splicing complexity at site C was found to be augmented in the transcripts of PMCA2 and PMCA3 through the use of additional exons, and in PMCA1 and 3 through the use of additional internal splice sites in the single alternatively spliced 154-base pair exon.