定量蛋白质组学分析的人类组织蛋白的转录后修饰。
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贝克HC,尼尔森EC, Matthiesen R,詹森LH Sehested M,芬恩P, Grauslund M,汉森,詹森
定量蛋白质组学分析的人类组织蛋白的转录后修饰。
摩尔细胞蛋白质组学。2006年7月,5(7):1314 - 25所示。Epub 2006 4月20。
- PubMed ID
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16627869 (在PubMed]
- 文摘
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组蛋白蛋白质受到一系列的转录后修饰在活细胞。这些修改的组合性质构成了“组蛋白密码”,决定染色质结构和功能在开发期间,细胞的生长、分化、和体内平衡。解密的代码组蛋白受到缺乏监测分析方法的组合复杂性可逆多点组蛋白的修饰,包括乙酰化和甲基化。为了解决这个问题,我们使用LC-MSMS技术和虚拟质量专家Spectrometrist软件组蛋白的定性和定量蛋白质组分析从人类小细胞肺癌细胞中提取。总共32乙酰化、甲基化和泛素化是位于人类组蛋白H2A、H2B, H3和H4,包括七个小说的修改。LC-MSMS-based方法定量蛋白质组学研究中应用的剂量反应的影响组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi) PXD101组蛋白乙酰化作用在人类细胞培养。一式三份LC-MSMS运行在6个不同浓度HDACi证明PXD101影响乙酰化组蛋白H2A、H2B, H3和H4因地制宜和剂量依赖性的方式。这个公正的分析显示,相对增加乙酰化肽组蛋白变体H2A、H2B,和H4伴随着相对减少dimethylated赖氨酸从组蛋白H2B (57)。剂量反应结果的定量蛋白质组学从HDACi-treated细胞组蛋白与免疫印迹分析,组蛋白乙酰化作用是一致的,细胞毒性,p21的表达谱存在剂量依赖的相关性和细胞周期蛋白A2。这表明质量spectrometry-based定量蛋白质组学分析的转录后修饰功能分析候选药物是一种可行的方法,比如HDAC抑制剂。