原子分辨率结构R-specific乙醇脱氢酶从短乳提供底物的结构基础和辅被用物特异性。

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Schlieben NH, Niefind K,穆勒J, Riebel B,无角的W,才D

原子分辨率结构R-specific乙醇脱氢酶从短乳提供底物的结构基础和辅被用物特异性。

J杂志。2005年6月17日,349(4):801 - 13所示。

PubMed ID

15896805 (在PubMed

]

文摘

R-specific酒精脱氢酶(RADH)短乳是一种NADP-dependent, homotetrameric延长酶家族的成员的短链脱氢酶/还原酶(SDR)具有高生物技术应用的潜力。其偏爱的体外基质与几乎总是一个小前手性的酮和苯乙酮甲基取代基之一和笨重的(通常是芳香族)一半。的基础上的一个原子水平结构野生型RADH在复杂辅酶ii和苯乙酮,我们设计了突变RADH-G37D,应该具备一种改进辅被用物特异性概要文件用于生物技术,即对NAD的偏好,而不是辅酶ii。比较动态测量与野生型和突变体RADH表明,实现这一目标。以成功的突变结构的特征,我们几个决定,部分原子水平,晶体结构的RADH-G37D作为酶朊和三元复杂的NAD和NADH和苯乙醇。增加亲和力的RADH-G37D NAD (H)取决于腺苷核糖基之间的交互NAD和插入的天冬氨酸侧链。结构比较RADH-G37D作为酶朊和三元复杂的Ser141披露重大重组的一部分,Glu144, Tyr189 Met205附近的活性部位。这种可塑性有助于产生一个小的疏水口袋RADH甲基典型的基质,和一个疏水涂层的第二,更多的变量,通常芳香,取代基。Ser141我们甚至发现替代构象的骨干。结构性适应性在这个地区,我们第一次在这里描述的特别提款权的酶,可能是功能很重要,因为它涉及Ser142,高度保守的催化四分体的典型成员特别提款权的酶。 Moreover, it affects an extended proton relay system that has been identified recently as a critical element for the catalytic mechanism in SDR enzymes.

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
(R) 1-phenylethanol	R-specific乙醇脱氢酶	蛋白质	短乳	未知的	不可用	细节

多肽

的名字	UniProt ID
R-specific乙醇脱氢酶	Q84EX5	细节