改进的模型构建和评估Calcium-sensing受体跨膜域。
文章的细节
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引用
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Bu L, Michino M,狼RM,布鲁克斯CL第三
改进的模型构建和评估Calcium-sensing受体跨膜域。
蛋白质。2008年4月,71(1):215 - 26所示。
- PubMed ID
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17932932 (在PubMed]
- 文摘
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人类Calcium-sensing受体的三维模型(CaSR)七个跨膜域建立了小说通过一个基于守恒的联系人在蛋白质序列比对方法使用牛视紫红质晶体结构作为模板。这个模型是由对接测试NPS 2143年首次发现变构CaSR拮抗剂。在我们的模型中,Glu837中起关键作用的质子化了的氮原子和羟基氧原子锚定NPS 2143。配体的苯一部分接触残留Phe668, Pro672, Ile841。周围几个疏水残基萘一部分,包括Phe684 Phe688, Phe821。我们的模型似乎符合所有六个残留已证明为NPS 2143绑定是至关重要的,在与现有的相同模型基于传统序列比对CaSR视紫红质。这提供了我们的序列比对方法的验证和使用中的视紫红质骨干作为初始结构同源性建模的其他G protein-coupled受体不视紫红质家族的成员。
DrugBank数据引用了这篇文章
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药物 目标 类 生物 药理作用 行动 nps - 2143 细胞外calcium-sensing受体 蛋白质 人类 未知的不可用 细节