细胞色素p - 4503a4底物的三维定量结构活性关系分析。

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Ekins S, Bravi G, Wikel JH, Wrighton SA

细胞色素p - 4503a4底物的三维定量结构活性关系分析。

中国药典杂志1999年10月;291(1):424-33。

PubMed ID

10490933 (在PubMed

］

摘要

为了更好地了解细胞色素P-450 (CYP) 3A4的活性位点，利用人肝微粒体CYP3A4 38种底物的结构和K(m(表观))值，构建了细胞色素P-450 (CYP) 3A4三维定量结构活性关系模型。该药效团使用Catalyst程序构建，包含四个特征:两个氢键受体，一个氢键供体和一个疏水区。药效团的观察值和预期K(m(表观))值的拟合值(r)为0.67。通过两次排列(随机)活性值和底物结构来验证CYP3A4底物模型的有效性。验证过程的结果表明，原始模型是CYP3A4底物所需特征的显著代表。第二种验证方法使用Catalyst模型来预测CYP3A4的结构多样化底物测试集的K(m(表观))值，该底物不包括在用于构建模型的38个分子中。研究了该软件中包含的两种拟合算法:快速拟合和最佳拟合。快速拟合方法的结果是，对所有12种基质的残差(即预测的和观察到的K(m(表观))之间的差)的预测都在1个对数单位内。相比之下，最佳拟合算法对12种基质中的4种的K(m(表观))值(即剩余>1 log单位)的预测效果很差。这些较差的拟合与最佳拟合函数表明，催化剂内的快速拟合方法更能代表观察到的CYP3A4底物的K(m(表观))值，并能很好地预测该活性。 A Catalyst common features pharmacophore was also constructed from three molecules known to activate their own metabolism included in the 38 molecules of the initial CYP3A4 model. This demonstrated that activators of CYP3A4 possess multiple hydrophobic regions that might correspond with a region in the active site away from the metabolic site.

引用本文的药库数据

药物酶

药物	酶	种类	生物	药理作用	行动
醋酸可的松	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 诱导物	细节
环孢霉素	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂	细节
氨苯砜	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物	细节
地塞米松	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂 诱导物	细节
醋酸地塞米松	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂 诱导物	细节
地塞米松isonicotinate	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	没有	底物 抑制剂 诱导物	细节
芬太尼	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物	细节
氢化可的松	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 诱导物	细节
氢化可的松aceponate	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 诱导物	细节
氢化可的松cypionate	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物	细节
氢化可的松磷酸	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物	细节
Paramethasone	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂 诱导物	细节
奎尼丁	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂	细节
利福	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 诱导物	细节
Saquinavir	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂	细节
西罗莫司	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	没有	底物	细节
他克莫司	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物	细节
长春花碱	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂 诱导物	细节
长春地辛	细胞色素P450 3 a4	蛋白质	人类	未知的	底物	细节