定义二硫键的胰岛素样生长因子结合protein-5串联质谱和电子转移离解和collision-induced离解。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Nili M,慕克吉Shinde U,大卫·L Rotwein P
定义二硫键的胰岛素样生长因子结合protein-5串联质谱和电子转移离解和collision-induced离解。
J生物化学杂志。2012年1月6日,287 (2):1510 - 9。doi: 10.1074 / jbc.M111.285528。Epub 2011年11月22日。
- PubMed ID
-
22117064 (在PubMed]
- 文摘
-
六的高亲和性胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)组成一个保守的家庭分泌分子调节IGF行动通过调节它们的半衰期和获得信号受体,并发挥生物效应是独立的IGF绑定。IGFBPs由cysteine-rich氨基- (N)和羧基(C)终端领域,连同cysteine-poor中央链接器部分。IGFBP-5是最保守的IGFBP,包含18个半胱氨酸,但只有2 9所假定的二硫键的映射。使用质谱(MS)的策略结合序贯电子转移离解(等)和collision-induced离解(CID)步骤,等碎片优先引发解理的二硫键,和CID提供精确的二硫键释放肽之间的分配,我们现在有了决定性地映射在IGFBP-5 5二硫债券。此外,结合分子建模我们能够从头开始分配中的其他二硫化四连杆GCGCCXXC主题,在五IGFBPs是守恒的。因为女士等分散实验的本质是没有化学还原IGFBP-5执行。不仅我们的结果建立一个二硫键的地图IGFBP-5还定义一个通用的方法,利用特异性的要领和串联的可伸缩性,女士和从头开始的预测能力分子建模描述未知蛋白质二硫联系。