构象变化和由乙醇脱氢酶催化。
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Plapp BV
构象变化和由乙醇脱氢酶催化。
拱生物化学Biophys。2010年1月1;493 (1):3 - 12。doi: 10.1016 / j.abb.2009.07.001。Epub 2009 7月5。
- PubMed ID
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19583966 (在PubMed]
- 文摘
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如图所示的x射线晶体学,马肝醇脱氢酶进行全球构象变化在绑定NAD(+)或NADH,涉及催化域的旋转相对于辅酶结合域和关闭的活性部位产生催化地高效的酶。构象的变化需要一个完整的辅酶和受到的各种化学或突变替换可以增加催化营业额通过改变异构化的动力学和辅酶的离解率。NAD(+)的绑定是活动的限制单分子异构化(对应于构象变化)控制的去质子化的催化zinc-water产生带负电荷的锌,可吸引带正电荷烟酰胺环。去质子化的促进了51代理通过氢键网络传递质子溶剂。绑定的NADH还包括一个构象的变化,但速度非常快。酶结合NAD(+)和收盘后,底物取代氢氧根绑定到催化锌;这种交流可能涉及双重置换反应的羧基谷氨酸残基的第一次取代氢氧化(反相的四面体配位锌),然后是外源性配体取代谷氨酸。结果enzyme-NAD(+)醇化物复杂将氢转移,和小构象波动可能带来反应物在一起以便氢化物离子传输的量子力学隧道。在这个过程中,烟酰胺环可能会皱,如结构和NADH复合物的酶。乙醇脱氢酶的构象变化演示的重要性在催化蛋白质动力学。