细胞色素P450 2 c8衬底绑定:结构的决定因素的复合体montelukast, troglitazone,非洛地平,9-cis-retinoic酸。

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Schoch GA,矢野JK Sansen年代,Dansette点,结实的CD,约翰逊EF

细胞色素P450 2 c8衬底绑定:结构的决定因素的复合体montelukast, troglitazone,非洛地平,9-cis-retinoic酸。

生物化学杂志。2008年6月20日;283 (25):17227 - 37。doi: 10.1074 / jbc.M802180200。Epub 2008年4月15日。

PubMed ID

18413310 (在PubMed

]

文摘

尽管晶体结构和药效团模型可用于细胞色素P450 2 c8,蛋白质的灵活性和特定的角色ligand-protein交互控制衬底绑定知之甚少。x射线晶体结构P450 2 c8包裹着montelukast (2.8), troglitazone(2.7),非洛地平(2.3),和9-cis-retinoic酸(2.6)测定检查ligand-protein交互对这些化学多样性的化合物。Montelukast是一个相对较大的阴离子抑制剂,展品三方结构和补充活性部位腔的大小和形状。活性部位的抑制剂troglitazone占地上部腔,留下大量腔闲置的一部分。较小的中性非洛地平分子与其dichlorophenyl隔离组定位接近血红素铁,和水分子填补的远端部分腔。9-cis-retinoic酸的结构复杂的同时显示两个底物分子结合P450 2 c8的活性部位。第二个9-cis-retinoic酸分子是近端上方的分子,可以抑制后者更有效地氧化的位置。解绑定不区分研究合作和非合作的模型为多个衬底绑定。结构不同的配体的配合物进一步演示活动site-constituting残留的构象适应性,尤其是参数- 241,可以调整在活性部位腔稳定带负电荷的官能团和定义两个空间不同的阴离子的半个底物结合位点。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物酶

药物	酶	类	生物	药理作用	行动
非洛地平	细胞色素P450 2 c8	蛋白质	人类	未知的	抑制剂	细节
Montelukast	细胞色素P450 2 c8	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂	细节
Troglitazone	细胞色素P450 2 c8	蛋白质	人类	未知的	底物 抑制剂	细节

多肽

的名字	UniProt ID
细胞色素P450 2 c8	P10632	细节