本机剪接体的纯化和表征适合三维结构分析。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

Jurica女士,Licklider, LJ, Gygi SR, Grigorieff N,摩尔乔丹

本机剪接体的纯化和表征适合三维结构分析。

RNA。2002年4月,8 (4):426 - 39。

PubMed ID

11991638 (在PubMed

]

文摘

我们描述的特征在当地条件下剪接体亲和纯化。这些剪接体主要由C复杂包含拼接中间体。后C复杂装配在一份affinity-tagged pre-mRNA基质含有3 '剪切位点突变,其次是消化的前体复合物早些时候,剪接体被排斥和亲和力大小选择净化。这个协议产生40 C复合物在足量可视化在负染色电镜。复合物纯化以这种方式包含U2, U5, U6核内小rna,但是很少U1或U4核内小rna。串联质谱的分析证实了存在核心snRNP蛋白质(SM和LSM), U2和U5 snRNP-specific蛋白质,和第二步因素Prp16, Prp17 Slu7, Prp22。相比之下,特定蛋白质剪接复合物早些时候,如U2AF和U1 snRNP组件,没有检测到C复杂,但在同样的净化H复杂。这些剪接体的图像显示单个粒子尺寸约为270 x 240协调到定义的类。这些图片代表一个重要的第一步pre-mRNA拼接获得一个全面立体的理解。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核核糖核蛋白H	P31943	细节
剪接因子3单元2	Q15428	细节
剪接因子3 b亚基3	Q15393	细节
异构核核糖核蛋白F	P52597	细节
异构核核糖核蛋白K	P61978	细节
剪接因子3单元3	Q12874	细节
小型核核糖核蛋白Sm D2	P62316	细节
丝氨酸/ arginine-rich剪接因子1	Q07955	细节
可能ATP-dependent RNA解旋酶DDX5	P17844	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PRP4同族体	Q13523	细节