蛋白质甲基化的免疫亲和富集和质谱分析。

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郭a，顾华，周杰，Mulhern D，王勇，Lee KA, Yang V, Aguiar M, Kornhauser J, Jia X, Ren J, Beausoleil SA, Silva JC, Vemulapalli V, Bedford MT, Comb MJ

蛋白质甲基化的免疫亲和富集和质谱分析。

Mol Cell Proteomics, 2014年1月;13(1):372-87。doi: 10.1074 / mcp.O113.027870。Epub 2013 10月15日。

PubMed ID

24129315 (PubMed视图

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摘要

蛋白质甲基化是一种常见的翻译后修饰，主要发生在精氨酸和赖氨酸残基上。精氨酸甲基化已被报道调节RNA加工，基因转录，DNA损伤修复，蛋白质易位和信号转导。赖氨酸甲基化最广为人知的是调节组蛋白功能，并参与基因转录的表观遗传调节。为了更好地研究蛋白质甲基化，我们开发了抗单甲基精氨酸的高度特异性抗体;不对称二甲基精氨酸;以及单甲基，二甲基和三甲基赖氨酸基序。这些抗体用于甲基肽的免疫亲和纯化，然后进行LC-MS/MS分析，以在几个模型研究中识别和量化精氨酸和赖氨酸甲基化位点。总的来说，我们在人类细胞系和小鼠组织中鉴定了超过1000个精氨酸甲基化位点，在人类细胞系HCT116中鉴定了大约160个赖氨酸甲基化位点。本研究中确定的甲基化位点数量超过了迄今为止文献中发现的甲基化位点。将在小鼠大脑中观察到的精氨酸甲基化蛋白与在小鼠胚胎中发现的精氨酸甲基化蛋白进行详细分析，表明精氨酸甲基化的组织特异性分布，并扩展了已知精氨酸甲基化的蛋白质类型，包括许多新的蛋白质类型。 Many arginine-methylated proteins that we identified from the brain, including receptors, ion channels, transporters, and vesicle proteins, are involved in synaptic transmission, whereas the most abundant methylated proteins identified from mouse embryo are transcriptional regulators and RNA processing proteins.

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
Calmodulin-2	P0DP24	细节
Calmodulin-3	P0DP25	细节
异质核核糖核蛋白A2/B1	P22626	细节
异质核核糖核蛋白H	P31943	细节
异质核核糖核蛋白H3	P31942	细节
剪接因子，富含脯氨酸和谷氨酰胺	P23246	细节
蛋白质二硫异构酶A3	P30101	细节
异质核核糖核蛋白K	P61978	细节
热休克70 kDa蛋白4	P34932	细节
染色质E亚家族成员SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调节因子1	Q969G3	细节
远上游元件结合蛋白2	Q92945	细节
异质核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
40S核糖体蛋白S19	P39019	细节
拼接因子1	Q15637	细节
Transgelin-2	P37802	细节
Zyxin	Q15942	细节
丝氨酸/精氨酸富剪接因子1	Q07955	细节
Transgelin	Q01995	细节
丝裂原活化蛋白激酶15	Q8TD08	细节
畸形激酶1	Q8N4C8	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Nek4	P51957	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 4	O96013	细节
电压门控钾通道亚单位β -2	Q13303	细节
elav样蛋白1	Q15717	细节
双特异性丝裂原活化蛋白激酶激酶4	P45985	细节
硫氧还蛋白还原酶3	Q99MD6	细节